免疫沉淀（IP）和免疫共沉淀（CO-IP）常用来研究蛋白质相互作用，将磁珠用于自动化的蛋白纯化过程可以大大提高实验的方便程度，同时改善结果的重复性。

在免疫沉淀（IP）和免疫共沉淀（CO-IP）实验中，推荐使用MP3（3.0 μm）磁性聚合物微球。该产品粒径适中，悬浮性较好，磁响应快。此外，其表面无孔的特性有助于降低非特异性吸附，提高结合蛋白的纯度。

当进行小规模高通量的蛋白纯化实验，如抗体展示时，MA 系列磁珠则更为合适，因为其水凝胶类型的基架具有极高的孔隙率和蛋白结合容量，即使抗体表达浓度较高也只需很少的磁珠即可完全结合。

应用案例—— MA-Protein A 磁珠从细菌裂解液中提纯抗体

将一定量的人IgG 加入到大肠杆菌裂解液中，构建类似于细胞表达抗体后的裂解液蛋白混合物，可用于评估磁珠对抗体的提纯效果。

结论：MA-Protein A磁珠可以有效地从细菌裂解液蛋白混合物中纯化人IgG。纯化后的洗脱液中只有IgG的单一条带，分子量为150kD左右，蛋白保持完整，无降解。样本a)和样本b)中人IgG加入总量分别为40 μg和80 μg，经过磁珠纯化后，回收得到蛋白量分别为29 μg和62 μg，平均回收率在75%左右。